Hay una gran diferencia entre estas dos palabras que pueden parecernos sinónimos al escucharlas, por lo menos en lo personal, son definitivamente opuestas.
El significado que doy a la palabra "comer" implica una acción mecánica, en la que se toma una porción de alimento y se ingiere. Así de simple, sin importar que tipo de sustancia es (solido, liquido, con alto o bajo contenido calórico), si contiene o no vitaminas, si es frito, asado, horneado, fast food o pollo asado.